細菌感染(20%):
細菌性腸炎的致病菌以痢疾桿菌最常見,其次為空腸彎曲菌和沙門氏菌。
病毒感染(20%):
在病毒性胃腸炎中,輪狀病毒是嬰幼兒腹瀉的主要病因,而諾瓦克病毒是成人和大齡兒童流行性病毒性胃腸炎的主要病因。
寄生蟲感染(15%):
寄生蟲引起的腸炎以溶組織內阿米巴較為常見。
真菌感染(15%):
真菌性腸炎以白色念珠菌引起的最多。
其他因素(10%):
休息無規律和精神過度緊張也是引起此病的一個原因。