1.無腦畸形
無腦畸形患兒不能外科手術治療，無腦畸形預后較差，絕大多數于出生時即為死胎，僅25%的患兒為活產，但極少能存活1周，多數于生后數小時死亡。
2.顱裂、腦膜膨出與腦腦膜膨出
單純顱裂一般無需特殊治療。
當合并腦膜膨出或腦腦膜膨出時，一般均需手術治療。手術時間過去認為在生后6～12個月為宜，近年來主張盡早手術，可在生后數天或數周內進行。手術目的是切除膨出的囊，還納膨出的腦組織等內容物，封閉顱骨缺損，防止發生進一步神經功能損害。如巨大腦膜膨出或腦腦膜膨出，合并神經系統癥狀，智力低下及明顯的腦積水者，無需手術治療。
3.脊柱裂
對脊柱裂所致的下肢癱瘓與肌肉萎縮，可試用針灸、按摩等康復對癥治療，但最終效果不滿意。隱性脊柱裂一般無需特殊治療。脊膜膨出和脊髓脊膜膨出的治療原則是早期手術治療。切除脊膜膨出囊和修補軟組織缺損，單純性脊膜膨出經此手術可以治愈。脊髓脊膜膨出手術時，通常需要向上、向下擴大椎板切開范圍，以探查脊髓與神經向脊膜囊內膨出的情況，有利于膨出的神經組織還納于椎管內。