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  • 發布時間:2024-07-05 14:41 原文鏈接: 尚恩答疑|細胞系STR鑒定原理及結果解讀

    1.  匹配度大于多少時,可認為待測細胞系與標準細胞系具有相關性?

    匹配度大于80%(EV值大于0.8)時,可認為待測細胞系與標準細胞系具有相關性


    2.  某個小鼠細胞鑒定匹配到另一個小鼠細胞,一定是錯誤細胞系嗎?

    不一定。首先去數據庫確認該細胞系有沒有公開的位點數據,如果有數據,且數據與檢測結果匹配不上,說明為錯誤細胞系。如果該細胞系沒有公開位點數據,則不能完全肯定是錯誤細胞系。由于小鼠品系不多,都是近交系(即近親交配),很容易出現同品系細胞相互匹配到的問題,需要根據細胞形態、功能、特異性marker等具體判斷細胞正確性。


    3. 沒有STR位點信息的細胞怎么鑒定正確性?

    綜合細胞形態、種屬鑒定、功能實驗結果或特異性marker進一步確認細胞正確性。


    4. 原代細胞需要做鑒定嘛?

    由于原代細胞傳代次數較少,一般不會選擇STR鑒定進行溯源。且來源于同一個體的雜細胞也無法通過STR鑒定來區分。因此鑒定原代細胞正確性和純度常選擇免疫熒光、流式等方法檢測特異性marker。


    5. 做STR可以判斷種屬的交叉嗎?

    若人源細胞中摻雜了大量其他種屬細胞,則可以在STR峰圖中看見波浪形或鋸齒形的雜峰;若人源細胞中摻雜了少量其他種屬細胞,STR鑒定可能無法判別,需要用CO I種屬鑒定等其他方法進一步確認。若小鼠細胞摻雜了人源細胞,可以被鑒定出來;若小鼠細胞摻雜了除了人以外的其他種屬細胞,雜細胞量較大時可以判別,雜細胞量較小時可能無法判別。


    6. 為什么有的小鼠細胞做了STR鑒定,但卻說只能鑒定出種屬?

    這些小鼠細胞系的位點信息還未錄入數據庫,沒有可以比對的數據,所以檢測結果不能確定是哪個小鼠細胞系。這些細胞經過小鼠STR基因檢測,確實測出了位點數據,這說明該細胞是小鼠細胞,并且沒有摻雜人的細胞。然而此時STR鑒定只能起到確定種屬的作用。


    7. 數據庫中沒有位點信息的細胞系可以做STR鑒定嗎?做了有什么意義?

    人、小鼠細胞可以做。其他物種的STR基因在開發中。

    沒有位點信息的細胞系做STR仍然是有意義的:

    1.STR檢測可以起到鑒定種屬正確性的作用,

    2. 首次引入細胞時檢測的STR位點信息可以作為今后的參考:在細胞長期培養后若發現細胞特性改變,可重新檢測STR基因,與首次引入時檢測的數據對比。


    8. 什么時候需要做STR鑒定?

    當實驗室引入新的細胞株,而供者未提供相關鑒定

    當細胞經過較長時間培養,發現細胞形態、功能等特性發生較大改變

    當懷疑實驗室保藏細胞時發生錯誤標記時


    9. 同一種細胞在不同細胞庫的位點信息怎么不一樣?

    細胞在漫長的傳代過程中可能發生基因突變,因此不同實驗室保存的細胞具體位點可能略有差異;另外,即使是同一個細胞庫保存的細胞,在不同檢測環境下也可能會有部分位點差異。所以包括ATCC DSMZ ECACC在內的大型細胞庫,相同的細胞都可能會有位點差異,根據國際細胞鑒定委員會(ICLAC)制定的細胞STR鑒定標準,細胞系的匹配度≥80% 時,認為它們具有相關性,即衍生于共同的祖先細胞。


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