異構酶isomerase 亦稱異構化酶，是催化生成異構體反應的酶之總稱。是酶分類上的主要類別之一。
根據反應方式而分類。
（1）結合于同一碳原子的基團的立體構型發生轉位反應（消旋酶、差向異構酶），如UDP葡萄糖差向酶（生成半乳糖）；
（2）順反異構；
（3）分子內的氧化還原反應（酮糖-醛糖相互轉化等），如葡萄糖磷酸異構酶（生成磷酸果糖）；
（4）分子內基團的轉移反應（變位酶），如磷酸甘油酸變位酶；
（5）分子內脫去加成反應（數字為酶編號的第2位數字）。其作用方式多種多樣，已知與各種輔酶參與。
