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  • 發布時間:2019-03-27 22:46 原文鏈接: 異硫氰酸胍/氯化銫超速離心法制備RNA實驗

    這種方法源自于對 Chirgwin 等(1979) 所擬方案的修改。對 Chirgwin 等所規定的試劑,許多試劑盒中常用,且用于分離和純化 RNA 的試劑也是常見的。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。

    實驗材料

    細胞和組織

    試劑、試劑盒

    氯仿氯化銫溶液二硫蘇糖醇EDTA乙醇異硫氰酸胍裂解緩沖液異丙醇N-月桂酰肌氨酸氯化鋰液氮β-巰基乙醇苯酚

    儀器、耗材

    離心機和轉子研缽和杵超速離心管

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液、溶液和試劑

    氯仿

    氯化銫溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化銫,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)

    用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水

    二硫蘇糖醇(DTT),0.2 mmol/L

    EDTA,1mmol/L,pH8.0

    乙醇,70%(體積分數)

    異硫氰酸胍裂解緩沖液 (4mol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)

    異丙醇

    N-月桂酰肌氨酸,20%(200 g/L)

    氯化鋰(LiCl),8mol/L

    液氮

    β-巰基乙醇,10 ml/L

    苯酚, 水飽和,pH4.0

    2. 離心機和轉子

    BeckmanTi50 轉子或相當的轉子

    3. 特殊設備

    研缽和杵,用 DEPC 處理過的水洗滌,預冷

    超速離心管(異質同晶共聚材料),或相當的 Polygon, 或相當的高速勻漿器

    4. 細胞和組織

    細胞/組織,凍于液氮

    二、方法

    1. 使用研缽和杵在液氮下將樣品研磨成細粉。使用 Polygon 均化器或其他合適的器具在 7 ml 胍裂解緩沖液中均質化組織或細胞(達 1X109 個)。

    2. 將 4 ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液加到超速離心管中。

    3. 將 1ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巰基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解產物中。

    4. 將氯化銫/裂解產物混合物混合,小心使之位于離心管中的氯化銫溶液上分層。

    5.20°C 下 180000 g 離心 21 h。

    6. 移棄氯化銫上清液,小心避免擾動管底的 RNA 沉降物。

    7. 小心將 RNA 沉降物再溶解于 750ul 異硫氰酸胍裂解緩沖液中。

    8. 加等體積酚,混勻。

    9.10000g 離心 15 min。

    10. 將水相轉移到一新管中。重復水相的酚抽提,直到界面變清。

    11. 向清澈的水相加 1 倍體積氯仿。

    12. 混合,l0000 g 離心 l0 min。

    13. 將水相轉移到一干凈試管中。加等體積的異丙酵和 1/10 體積 8mol/L 的氯化鋰。10000g 離心10min。

    14. 移棄上清液。用 750ul70% 乙醇洗滌 RNA 沉降物,10000 g 離心。

    15. 移棄乙酵,風干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L 的 DTT 中。

    16.RNA 儲存于-70°C。


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