張亞平院士CellResearch發表基因組研究重要成果

　　來自中科院昆明動物研究所、云南大學、瑞典皇家理工學院等機構的研究人員，報告稱他們通過收集來自世界各地58個犬科動物的基因組序列，揭示出了家犬的自然史。這一重要的研究成果發布在12月15日的《細胞研究》（Cell Research）雜志上。

　　中科院昆明動物研究所的張亞平（Ya-Ping Zhang）院士，及瑞典皇家理工學院的副教授Peter Savolainen是這篇論文的共同通訊作者（延伸閱讀：張亞平院士等：解析lincRNA的DNA甲基化 ）。

　　家犬是動物王國中人類最親密的伙伴之一，一直跟隨著我們去到世界各大洲。作為一個單一物種，馴養狗體現了地球上生存物種最大的表型多樣性。因為它們出色的認知和行為能力，馴養狗被人類選中來完成各種各樣的任務，包括狩獵、放牧和陪伴。這些表型改變的遺傳和歷史基礎一直困惑著包括達爾文在內的科學界人士。

　　狗的馴養史常被描述為是一個分兩階段的過程，在第一階段人類首先將野生的祖先灰狼馴養為原始狗，在第二個階段進一步選擇原始狗形成許多具有特殊能力和形態的狗品種。盡管科學家們付出了許多努力來研究狗進化，關于馴養狗起源和進化的幾個基本方面仍然存在爭議。例如，幾個不同的地理區域被提出是馴養狗的發源地，狼和狗的分歧時間預計在3.2萬―1萬年前，自它們分歧后這兩個種群之間有相對弱的基因流動。但狗的確切馴養史仍有待充分闡明。

　　第一次對狗的地理起源進行全面的遺傳調查，是基于在當代狗中開展廣泛的種內母系遺傳DNA(mtDNA)研究，強有力的跡象表明狗起源于東亞的南部地區。然而，幾個基于不同遺傳標記的后續研究給出了不一致的答案。例如，利用來自古老狗樣本的mtDNA，Thalmann等提出歐洲是起源地。同樣，通過對現代狗進行全基因組基因分型，vonHoldt等發現中東狼和狗之間高單體型共享，提出了中東是狗多樣性主要的發源地。

　　盡管這些研究采用了不同的數據集和方法，這些基于單核苷酸多態性（SNP）微陣列和DNA的研究有一個共同的缺點，就是缺乏來自東南亞的樣本，因此排除了馴養狗實際上起源于這一地區的可能性。此外，利用單個位點，尤其是mtDNA，由于更易受到隨機和/或選擇力的影響可曲解結論。因此，狗的馴養史仍然是個謎題，而極具爭議性。

　　在這篇文章中，研究人員利用總共58個犬科動物（12只灰狼、27只來自亞洲和非洲的原始狗，及來自世界各地19個不同品種）的全基因組序列，發現來自東南亞的狗相比其他種群具有顯著更高的遺傳多樣性，是與灰狼有親緣關系的最基礎的種群，表明馴養狗古老的起源是在3.3萬年前的東南亞。大約1.5萬年前，一部分祖先狗開始遷移到中東、非洲和歐洲，在大約1萬年前到達歐洲。走出亞洲的其中一個譜系又遷移回到東方，在遷移至新大陸之前與中國北部的地方性亞洲譜系形成了一系列混雜種群。

　　因此，這項新研究第一次揭示出了馴養狗在地球上的非凡旅程。