1．遺傳背景宿主的遺傳背景對抗原的免疫原性有明顯影響。機體對抗原的應答能力受多種遺傳基因尤其是主要組織相容性復合體(MHC)的控制。不同遺傳背景的小鼠及人群中的不同個體，由于MHC基因不同，濕示對同一抗原的應答能力不同。對某一抗原反應性強的小鼠品系或人，對其他抗原可能呈低反應性。MHC基因及其他免疫調控基因的差異導致不同個體對同一抗原的免疫應答能力不同。
2．年齡、性別與健康狀態通常情況，青壯年比幼年和老年人的應答能力強雌性動物產生抗體的能力要強于雄性動物，但妊娠期動物的應答能力明顯減弱，同時發生南自身抗體介導的自身免疫病的概率也增高。感染或使用免疫抑制劑等都能使機體對抗原的免疫應答顯著減弱 。