關于抽提質粒:
1) 抽提質粒時,加入 Solution II和 III后要求輕柔混勻。我個人覺得不用這樣,只要不是
非常劇烈,可以快速混勻。尤其可以運用在一次抽提多管質粒的時候,這樣可以快速,而且
效果一點也不差。
2) 抽提質粒時,用無水乙醇沉淀的時間可以由實驗操作者來決定,如果時間充裕可以 30
min,否則 8-10 min 也可以。至于溫度,個人覺得-20℃好于常溫。如果加入可醋酸鈉,會較
容易形成鹽類雜質,所以時間短一些更好!
3) 質粒小提如果是用作鑒定或酶切,不必進行酚仿抽提,將溶液 1,2,3 離心后的清液移
入一個新的 1.5ml 離心管中,再次離心 3-5 min,小心取出上清液后,直接沉淀,不必擔心
DNA 切不開,我已經這樣使用一年多,沒出過什么問題。當然這樣的質粒不很干凈,但是
做鑒定足夠了。尤其是實驗室女同胞們,可以減少酚仿的侵害,而且節省時間。
4)有時沉淀東西,由于沉淀量很少,離心完之后不知道到底有沒沉淀下來東西,由于量很
少,不好觀察,所以離心時建議按特定的方向放置離心管,這樣你就可以在離心之前確定沉
淀該沉淀到管子的大致部位,這樣離心后就可直接觀察那有沒有沉淀,避免滿管子找,另外
看沉淀時可以對光看,這樣就是顆粒狀的細小沉淀也能看見的,我覺得我們制備好了一批感
受態,最好馬上轉化一種已知質粒。與此同時,取一點感受態接種到含抗性的固/液體培養
基培養來做對照。這樣第二天即可以知道這批感受態是否還有外源質粒,又可以知道這批感
受態轉化效率的高低。如果合格,那以后就可以放心使用!因為我也曾經遇到其實是因為感
受態不好而導致試驗不成功,但是當時不知道,結果費時費力。
5)提取質粒的時候,最后一步的酒精揮發很關鍵,基本上是其后續的酶切反應的決定性因
素。所以這一步盡量揮發長一點時間,最好是空調吹熱風,或是 37℃溫箱放長一點的時間,
我試過室溫過夜,酶切很好。
6)在做克隆鑒定的時候經常需要在酶切鑒定前進行 PCR 鑒定,每次配置 PCR 反應液很繁
瑣,可以將其配置類似 Kit 的形式,按你需要的反應體系列表,然后放大 100 倍配置 100×
主反應液(100 次反應),其中含 Buffer,Mg2+,dNTPs,但不含引物和 Taq 酶,然后可以
10×分裝或一管儲存在-20℃,在需要的時候拿出融開,然后按所需的 PCR 反應個數吸取相
應的倍數,再補加相應反應倍數的 Taq 和引物,混勻后分裝,這樣做的好處如下: 1)節省
時間;2)避免每次反應加樣不均的可能;3)大大減少 PCR假陽性的產生。