1、高聚物基PCR微流控芯片
PCR作為一種體外擴增核酸的方法,早已是研究分子生物學的不可缺少的工具。雖然傳統的PCR操簡單,但是它加熱循環緩慢且效率低,這主要是因為其加熱體積太大。為了解決這個問題,PCR的反應體積被減少到5oul甚至于1pl,但是體積的減少相應的也限制了產量。PCR微流控芯片就是在這種情況下發展起來的。
與傳統的PCR相比,PCR芯片的主要優勢在其比表面積大,傳熱速率快,大大提高了反應速度;而且內部溫度均勻,反應過程易于控制。同時PCR芯片反應所需的樣品和試劑量少,大大降低成本。如KOPP利用PCR微流控芯片在1.5-18.7min的時間內,經過20次循環完成了淋球菌促旋酶基因176bp片段的PCR擴增。
2、核酸限制性酶切片段的分離分析
微流控芯片可用于迅速分離DNA限制片段PCR產物,比常規的毛細管電泳分離要快得多。自從Manz等成功的應用微流控芯片毛細管電泳技術分離了寡核苷酸混合物。微流控芯片分離的DNA片段的長度在逐步擴大,同時出現了可進行平行分析的多通道陣列芯片。
3、DNA測序
用微流控芯片四色標記法測序,可在540S分離150個堿基,準確率在97%以上。常規DNA測序需要制備微升級的樣品,試劑消耗量大,有報道將納升級的樣品制備系統微縮到芯片上進行測序,可在分離前除去多余的引物、鹽分、核苷酸等,所用測序體積是Sanger雙脫氧終止法的1/300,測序成本明顯降低,而且可進行固相測序。
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