念珠菌是真菌中最常見的條件致病菌。它常寄生于人的皮膚、口腔、陰道和腸粘膜等處，當機體免疫機能低下或正常寄居部位的微生態環境失調，容易引起念珠菌病。念珠菌可引起皮膚粘膜淺層或全身系統性感染，感染不同部位可引起不同的疾患，除皮膚念珠菌病外，還有念珠菌性口腔炎、陰道炎、膀胱炎、腎盂腎炎、腦膜炎、菌血癥和膽道感染等。
直接涂片鏡檢
采集患處病灶組織、偽膜、滲液、痰、糞便等標本直接鏡檢見到假菌絲或厚膜孢子，是最為簡單而重要的診斷方法。
真菌培養
患處真菌培養呈陽性對明確診斷具有決定性意義，培養檢查對確定菌種及敏感藥物的選擇均具有重要臨床價值。
糞便檢查
消化道念珠菌病一般為稀便、水樣便或豆腐渣樣便，多泡沫，有發酵氣味，嚴重者形成腸粘膜潰瘍而出現便血。
心肌酶譜
播散性念珠菌病綜合征和念珠菌菌血癥往往CK、CK-MB、AST、LDH均有不同程度的增高。
尿液分析
泌尿道念珠菌病有WBC增多，尿蛋白陽性。
腎功能
泌尿道念珠菌病和播散性念珠菌病綜合征可有BUN、Cr增高。
組織病理學檢查
病理組織中發現真菌和相應病理改變，即可確診。
其他檢查
深部真菌病患者細胞免疫功能低下，白細胞移動抑制因子（LIF）缺乏，移動抑制指數（MI）>0.8。當天疾病靜止或好轉時，二者均恢復正常，可以作為病情診斷和預后判斷的指標。