腎絞痛患者首要的任務是鎮痛和解除腎盂和輸尿管平滑肌痙攣。對于因惡心、嘔吐導致脫水的患者，可以建立靜脈通道，補充水、電解質，同時給以鎮痛、鎮吐治療。常用的解痙藥物有鹽酸消旋山莨菪堿、阿托品、心痛定、鹽酸坦洛新；常用的鎮痛藥物有非甾體抗炎（NSAIDs）藥和麻醉性鎮痛藥，如嗎啡、哌替啶、布桂嗪、吲哚美辛栓等，多用甲氧氯普胺作為止吐藥物。同時針對結石采取“除石”治療。如果腎臟有基礎病變的患者使用可能會誘發急性腎衰。
1、沖擊波碎石（SWL）
SWL問世之時就用來治療急性腎絞痛，但存有爭議。目前認為，用SWL治療結石并發腎絞痛有其合理性。輸尿管結石SWL的最佳適應證是小于1cm的結石。治療過程中要注意仔細觀察，結石粉碎即可，避免過量沖擊。
2、輸尿管鏡取石
對于大于1cm的輸尿管結石，在治療遠端輸尿管結石時（髂血管以下水平）有時也被作為首選療法。在輸尿管取石之后，均應放置輸尿管導管，即使取石失敗。
3、對于尿石癥合并其他病變者
如先天性泌尿系統畸形（如馬蹄腎、腎盂輸尿管連接部梗阻）、腎結核、輸尿管狹窄、結石引起癌變等，宜行開放手術治療。
4、祛除病因
在清除結石的同時，應該積極治療尿石癥病因。