大多數病例起病緩慢，低熱、乏力、疲倦，少數起病急，有寒戰、高熱或栓塞現象，部分患者起病前有口腔手術，呼吸道感染，流產或分娩的病史。
1、全身性感染發熱最常見，常呈原因不明的持續發熱一周以上，不規則低熱，多在37.5℃-39℃之間，也可為間歇熱或弛張熱，伴有乏力、盜汗、進行性貧血脾腫大，晚期可有杵狀指。
(1)發熱：有80%～88%病例有發熱型多變，以不規則發熱為多見可為間歇熱或弛張熱，不少病例表現為低熱可伴畏寒或多汗。近年來不少病人無發熱可能與早期使用抗生素有關高齡患者可能與反應性差有關。
(2)其他與感染有關的癥狀，如乏力、食欲減退、消瘦進行性貧血、多汗和肌肉酸痛等。
(3)杵狀指(趾)在發病1～2個月以后出現且無發紺，以往約見1/3病例，且作為重要體征之一，但近年來已大大減少肝、脾腫大一般為輕至中度增大索，以往至少有半數病人有脾大，1/4病例有肝大但近年來肝、脾腫大亦明顯減少。
2、心臟表現固有的心臟病的體征，由于贅生物的增長或脫落，瓣膜、腱索的破壞，雜音多變，或出現新的雜音。若無雜音時也不能除外心內膜炎存在，晚期可發生心力衰竭。當感染波及房室束或室間隔，可引起房室傳導阻滯及束支傳導阻滯，心律失常少見，可有早搏或心房纖顫。
3、栓塞現象及血管病損
(1)皮膚及粘膜病損由感染毒素作用于毛細血管使其脆性增加而破裂出血，或微栓塞所引起。可在四肢以皮膚及眼鹼結合膜、口腔粘膜成批出現瘀點，在手指、足趾末節掌面可出現稍高于表面的紫或紅色的奧氏(Osler)結節，也可在手掌或足部有小結節狀出血點(Janewey結節)，無壓痛。
(2)腦血管病損可有以下幾種表現：
①腦膜腦炎類似結核性腦膜炎，腦脊液壓力增高，蛋白及白細胞計數增加，氯化物或糖定量正常。
②腦出血有持續性頭痛或腦膜刺激癥狀，系由于細菌性動脈瘤破裂引起。
③腦栓塞病人發熱，突然出現癱瘓或失明。
④中心視網膜栓塞可引起突然失明。
4、腎栓塞最常見，約占1/2病例，有肉眼或鏡下血尿，嚴重腎功能不全常由于細菌感染后，抗原-抗體復合物在腎血管球內沉積，引起腎血管球性腎炎的結果。
5、肺栓塞常見于先天性心臟病并感染性心內膜炎的病例，贅生物多位于右心室或肺動脈內膜面，發病急，胸痛，呼吸困難，咳血，紫紺或休克。若梗塞面積小，也可無明顯癥狀。
此外，還可有冠狀動脈栓塞，表現為急性梗塞，脾栓塞有左上腹痛或左季肋部痛，有發熱及局部摩擦音。腸系膜動脈栓塞，表現為急腹癥，血便等。四肢動脈栓塞可有栓塞肢體蒼白發冷，動脈搏動減弱或消失，肢體缺血疼痛等。