1、腸息肉、結腸癌：直腸炎超過五年，腸道潰瘍面在炎癥的長期刺激下容易異常增生，引發腸息肉，一厘米以上腸息肉癌變率極高；
2、腸狹窄：多發生在病變廣泛、病程持續長達5-25年以
上的病例，其部位直腸，臨床上一般無癥狀，嚴重時可引起腸阻塞，在本病出現腸狹窄時，要警惕腫瘤，鑒別良性惡性。
3、肛竇炎：直腸炎不及時治療，可并發肛竇炎等肛腸病，并有繼發肛周膿腫的危險。
4、肛管炎：這是本病的一個并發癥，經常與直腸炎并稱為肛管直腸炎，肛管炎久拖不治亦有癌變危險。
5、便血：便血是本病的主要臨床表現之一，便血的多少也是衡量病情輕重的指標。長期慢性出血可引起缺鐵性貧血。