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  • 發布時間:2020-09-07 17:10 原文鏈接: 總RNA提取與Northern雜交(3)

    第二天:

    將上述物品揭開,將膠正面朝下,膜正面朝上,用鉛筆作好標記。

    將膠浸泡在EB中1-2分鐘,用DEPC H2O清洗,將膜放在濾紙上面,夾好,4度下保存,或者直接進行預雜交。

    UV雜交(有助于RNA結合到膜上面)。

    五、預雜交和雜交

    預雜交和雜交 buffer: 100ul

    20×SSC 25ml (5×SSC)

    甲酰胺 50ml (50%)

    N-lauroylsarcosine: 0.1g(0.1%)

    20% SDS 100ul(0.02%)

    blocking reagent 2g(2%)

    DEPC H2O 25ml

    (一)預雜交:

    預雜交buffer 在55-65度下加熱,溫度取決于探針的質量。如果溫度低,則會得到更多非特意的條帶:對于周探針較好。如果溫度高,則會得到高結合力的條帶:探針較好。

    把膜裝進一個塑料袋中,RNA在一邊,密封。

    在預雜交buffer中培養,55-65度,輕搖,過夜。越長越好。但是要確保溶液蓋到膜。

    (二)雜交:

    buffer 在55-65度下加熱,棄去塑料袋中的預雜交buffer,將探針buffer裝進,55-65度下培養過夜,輕搖。

    注意:預雜交和雜交都是在同一溫度下進行。

    雜交后:

    1、 清洗:室溫下用2×SSC,0.1%SDS清洗,5分鐘,2次。

    2×SSC, 0.1%SDS

    10 ml 20×SSC

    500ul 20%SDS

    加DEPC H2O 至100 ml

    2、 清洗: 55-65度,用0.1-0.5 SSC清洗2次,每次15分鐘。

    SSC buffer 的濃度、溫度取決于探針的質量。濃度越低、溫度越高,則會得到更高的效果。

    Buffer在使用之前要先加熱。
    3、清洗

    室溫下用1×MA-T清洗,1分鐘,1次。

    1×MA-T

    100ml 10×MA

    900ml DEPC H2O

    3ml Tween 20 (占總的0。3%)

    10×MA(室溫下儲存)

    1M 順丁烯二醛

    1.5M NaCl

    不容易溶解,可以加入70gNaOH 調節到1L。并且調節PH=7。5

    4、阻斷:

    室溫下blocking buffer,30 min

    blocking buffer

    1g 阻斷劑

    100ml 1×MA-T

    稍微加熱充分溶解。

    5、DIG- Ab

    室溫下用Ab- blocking buffer,30 min

    Ab :blocking buffer= 1:5,000

    重要:抗體離心后取出上清液

    6、清洗

    室溫下用1×MA-T清洗,15分鐘,2次。

    7、檢測

    (1)將膜用 detection buffer 培養2-3分鐘,即清洗一遍。

    detection buffer

    100mM Tris-HCL

    100Mm NaCl

    PH=9.5

    (2)將膜取出,置于塑料薄膜上。

    (3)用適量的CDP-Star(約1毫升),將膜均勻潤濕,涂勻,將塑料薄膜合上,中間不能有空氣和皺折。 等待5分鐘。

    (4)用吸水紙將膜邊緣的CDP-Star吸去,用熱將塑料薄膜密封。

    (5)檢測(暗室操作,去校醫院放射科)。

    (6)分析統計。

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