第二天:
將上述物品揭開,將膠正面朝下,膜正面朝上,用鉛筆作好標記。
將膠浸泡在EB中1-2分鐘,用DEPC H2O清洗,將膜放在濾紙上面,夾好,4度下保存,或者直接進行預雜交。
UV雜交(有助于RNA結合到膜上面)。
五、預雜交和雜交
預雜交和雜交 buffer: 100ul
20×SSC 25ml (5×SSC)
甲酰胺 50ml (50%)
N-lauroylsarcosine: 0.1g(0.1%)
20% SDS 100ul(0.02%)
blocking reagent 2g(2%)
DEPC H2O 25ml
(一)預雜交:
預雜交buffer 在55-65度下加熱,溫度取決于探針的質量。如果溫度低,則會得到更多非特意的條帶:對于周探針較好。如果溫度高,則會得到高結合力的條帶:探針較好。
把膜裝進一個塑料袋中,RNA在一邊,密封。
在預雜交buffer中培養,55-65度,輕搖,過夜。越長越好。但是要確保溶液蓋到膜。
(二)雜交:
buffer 在55-65度下加熱,棄去塑料袋中的預雜交buffer,將探針buffer裝進,55-65度下培養過夜,輕搖。
注意:預雜交和雜交都是在同一溫度下進行。
雜交后:
1、 清洗:室溫下用2×SSC,0.1%SDS清洗,5分鐘,2次。
2×SSC, 0.1%SDS
10 ml 20×SSC
500ul 20%SDS
加DEPC H2O 至100 ml
2、 清洗: 55-65度,用0.1-0.5 SSC清洗2次,每次15分鐘。
SSC buffer 的濃度、溫度取決于探針的質量。濃度越低、溫度越高,則會得到更高的效果。
Buffer在使用之前要先加熱。
3、清洗
室溫下用1×MA-T清洗,1分鐘,1次。
1×MA-T
100ml 10×MA
900ml DEPC H2O
3ml Tween 20 (占總的0。3%)
10×MA(室溫下儲存)
1M 順丁烯二醛
1.5M NaCl
不容易溶解,可以加入70gNaOH 調節到1L。并且調節PH=7。5
4、阻斷:
室溫下blocking buffer,30 min
blocking buffer
1g 阻斷劑
100ml 1×MA-T
稍微加熱充分溶解。
5、DIG- Ab
室溫下用Ab- blocking buffer,30 min
Ab :blocking buffer= 1:5,000
重要:抗體離心后取出上清液
6、清洗
室溫下用1×MA-T清洗,15分鐘,2次。
7、檢測
(1)將膜用 detection buffer 培養2-3分鐘,即清洗一遍。
detection buffer
100mM Tris-HCL
100Mm NaCl
PH=9.5
(2)將膜取出,置于塑料薄膜上。
(3)用適量的CDP-Star(約1毫升),將膜均勻潤濕,涂勻,將塑料薄膜合上,中間不能有空氣和皺折。 等待5分鐘。
(4)用吸水紙將膜邊緣的CDP-Star吸去,用熱將塑料薄膜密封。
(5)檢測(暗室操作,去校醫院放射科)。
(6)分析統計。