1.血液檢查
(1)血培養：是確診本病的主要依據，而且還可以隨訪菌血癥是否持續。在抗生素應用之前應做好血培養，有75%～85%患者血培養陽性，也是診斷本病的最直接的證據。取靜脈血10～20ml，最好在高熱寒戰時采血，且多次采血培養以提高陽性率。同時應作厭氧菌培養，至少保留觀察2 周。15%～20%感染性心內膜炎血培養陰性，尤其是隱球菌、念珠菌性感染性心內膜炎和長時間感染性心內膜炎應用抗生素后。若靜脈血培養陰性，必要時可采用動脈血、骨髓或栓子培養。也可根據病情發展及治療反應作出診斷。
(2)一般化驗檢查：紅細胞和血紅蛋白降低，后者大都在6%～10g%。偶可有溶血現象。血白細胞增高或正常，分類中可有單核細胞增多，血沉增快，血清γ球蛋白增高，IgG、IgM 增高，補體降低，類風濕因子陽性。急性感染性心內膜炎患者血常規檢查常見血白細胞明顯增多，中性粒細胞核左移，可有中毒顆粒,有時可見到左移。此外，可出現進行性貧血。血培養易獲陽性致病菌，且多為化膿性細菌。
(3)血清免疫學檢查 亞急性感染性心內膜炎病程長達6 周者，50%類風濕因子呈陽性，經抗生素治療后，其效價可迅速下降。有時可出現高γ 球蛋白血癥或低補體血癥，常見于并發腎小球腎炎的患者，其下降水平常與腎功能不良保持一致。約有90%患者的循環免疫復合物CIC 陽性，且常在100μg/ml 以上，比無心內膜炎的敗血癥患者高，具有鑒別診斷的價值，血培養陰性者尤然。但要注意系統性紅斑狼瘡、乙型肝炎表面抗原陽性患者及其他免疫性疾病中CIC 血清水平也可大于100μg/ml。其他檢查尚有真菌感染時的沉淀抗體測定、凝集素反應和補體結合試驗。金黃色葡萄球菌的胞壁酸抗體測定等。
2.尿液分析 半數以上患者可出現蛋白尿和鏡下血尿或肉眼血尿，紅細胞呈多形型，少部分可有紅細胞管型，輕度蛋白尿，但膿尿或管型尿也偶有發生，有的尿常規也可正常。當腎功能衰竭時則出現相應的變化，血尿素氮和肌酐輕度增高，但也可發生嚴重或進行性腎功能衰竭。