以手術治療為主，原則是清除死骨、炎性肉芽組織和消滅死腔，即病灶清除術。
1.手術指征：有死骨形成，有死腔及竇道流膿者均應手術治療。
2.手術禁忌證：
（1）慢性骨髓炎急性發作時不宜作病灶清除術，應以抗生素治療為主，積膿時宜切開引流。
（2）大塊死骨形成而包殼尚未充分生成，過早取掉大塊死骨 會造成長段骨缺損，須待包殼生成后再手術。但近來有感染下植骨成功的，為相對禁忌證。
3.手術方法：術前作細菌培養和藥敏試驗，最好在術前2日開始應用抗生 素。同時必須解決：a.病灶的清除；b.消滅死腔；c.傷口的閉合這三個問題。
（1）清除病灶：
（2）消滅死腔：a.碟形手術治療；b.肌瓣填塞；c.閉式灌流：灌洗持續時間一般為2～4周，待吸引液轉為清晰時即可停止灌洗并拔管；d.慶大霉素－骨水泥鏈珠填塞和二期植骨：2周后可拔珠。
（3）傷口的閉合：最好一期縫合，并留置負壓引流管。傷口不能閉合，竇道不能消滅的主要原因是病灶清除不徹底與不能消滅死腔。