①腸出血：腸道病變廣泛，或侵及腸壁血管時可引起便血。腐蝕大血管造成的大出血罕見，病情危急，常導致休克。
②腸穿孔：嚴重的深及漿膜的阿米巴潰瘍可導致穿孔，多見于盲腸、闌尾和升結腸，往往有多處穿孔。大多緩慢發生，無劇烈的腹痛，穿孔的具體時間難以確定。患者有進行性腹脹，嘔吐、失水，全身情況迅速惡化。腸鳴音消失，伴局部腹膜刺激征。腹部平片見膈下游離氣體，有腸粘連時形成局部膿腫或內瘺。
③闌尾炎：阿米巴闌尾炎癥狀與普通闌尾炎相似。易形成膿腫。慢性腹瀉或阿米巴腸病史，糞便中找到阿米巴有助于鑒別診斷。
④非痢疾性結腸病變：系增生性病變引起，包括阿米巴瘤、腸道阿米巴性肉芽腫、纖維性狹窄。阿米巴瘤為大腸壁的炎性假瘤，以腹痛和大便習慣改變最多，部分伴間歇性痢疾，可誘發腸套疊及腸梗阻，主要體征為右髂窩觸及可移動的、有壓痛、光滑的鵝卵形或腸曲樣塊物，X線上見占位性病變，對抗阿米巴治療有良好效果。