我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜

　　在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序技術繪制小鼠細胞圖譜）為題，于2018年2月23日在生命科學國際頂尖期刊Cell（《細胞》）雜志在線發表。論文鏈接：http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30116-8。

圖. 小鼠細胞圖譜的構建

　　長久以來，生命科學的研究主要針對群體細胞樣品進行處理、分析和統計進而獲得均值水平的實驗結果。直到近幾年單細胞組學技術的出現，才使我們能夠從單細胞的水平更加精確地解析每個細胞究竟在表達哪些基因，在機體分化、再生、衰老以及病變過程中這些基因的表達又發生哪些變化以及變化的幅度有多大等問題。因此，單細胞組學分析技術不僅在方法學上是繼傳統的細胞檢測、分類和鑒定技術的一次突破，而且其結果也將會對經典的細胞發生、組織分化、器官發育及功能穩態維持的分子細胞機制帶來新的理解和認識。

　　在這項工作中，郭國驥教授團隊自主開發一套高精度、低成本、國產化的Microwell-seq高通量單細胞分析平臺，對來自小鼠近50種器官組織的40余萬個細胞進行系統性的單細胞轉錄組測序，構建首個哺乳動物全細胞圖譜。該研究基本涵蓋了哺乳動物體內的各種主要細胞類型，并對每一種器官內的組織細胞亞型，基質細胞亞型，血管內皮細胞亞型和免疫細胞亞型的基因表達譜進行詳細描述，繪制一幅精美的“細胞地圖”。更為有趣的是，這項研究發現來自于不同組織的基質細胞，具有完全不同的基因表達特征，從而對于組織特異性微環境行使重要的調節作用。同時此項工作還構建小鼠單細胞轉錄組數據庫以及小鼠細胞圖譜網站（http://bis.zju.edu.cn/MCA/）以提供單細胞數據比對系統，任何單細胞表達譜數據都可以通過單細胞比對分析尋找到它所對應的細胞類型和來源。這項成果將為細胞命運決定的機制研究、再生醫學的移植前細胞鑒定以及臨床疾病的細胞水平診斷提供技術手段和分析方法。