在某些扎那米韋耐藥和奧司它韋耐藥的由細胞培養的流感病毒突變體中已發現交叉耐藥性。不過某些細胞培養的扎那米韋耐藥突變體如E119G/A/D和R292K,與奧塞米韋耐藥的臨床隔離群一樣突變發生在神經氨酸酶相同的氨基酸位置,如E119V和R292K。還沒有進行臨床使用會引起交叉耐藥風險的評估研究。