Rathke裂囊腫是一種先天性囊腫，來源于胚胎顱咽管的殘余上皮細胞。在胚胎4周時，原口上方外胚胎層細胞向上凸出形成Rathke囊，在胚胎7周前閉合而成顱咽管，其前壁形成垂體陷凹，以后發育成垂體前葉；后壁細胞增生較少，發育成垂體中葉。Shanklin（1949）在100例正常尸檢中發現22例于這兩種組織間殘存腔隙，其中13例形成小囊腫，儲有囊液而無臨床癥狀，將其稱為Rathke裂。此后陸續有作者發現該裂形成的囊腫可逐漸增大，對周圍結構造成壓迫而產生臨床癥狀，將其稱為癥狀性Rathke裂囊腫。E1-Mahdy（1998）報告28例，其中單層柱狀或立方上皮占71.4%，假復層鱗狀上皮占17%，混合上皮細胞占7%；囊內液體透明微黃者占21.4%，粘稠混濁或粘液狀者占60.7%，其顏色由綠至棕褐色不一。此外，也有作者報告其內容類似上皮樣囊腫。