1、阿米巴痢疾
1.檢驗 ①大便常規，注意找痢疾阿米巴滋養體及包囊。②血常規。③必要時送大便培養痢疾桿菌與痢疾阿米巴原蟲，入院時及次晨各送一次，以視有無混合感染。
2.特殊檢查 慢性病例治療前后作乙狀結腸鏡檢查，并刮取標本檢查痢疾阿米巴原蟲，如疑有并發阿米巴瘤或腸息肉及疑為炎癥性腸病、腸結核、結腸癌等疾病時，應做纖維腸鏡檢查及活檢或腸道鋇劑X線檢查。
3.疑似病例 根據條件酌情選送痢疾阿米巴原蟲特異性免疫學檢查。
4.診斷性治療 疑似病例可用抗阿米巴藥物作診斷性治療。
二、細菌性痢疾
急性菌痢 1.近周內有不潔的飲食史或與菌痢病人密切接觸史。 2.急性腹瀉伴有發冷、發熱、腹痛、腹瀉、里急后重，排粘液膿血便，左下腹有壓痛。 3.血象：白細胞總數和中性粒細胞增加。 4.糞便常規：粘液膿血便。鏡檢有大量膿細胞、紅細胞與巨噬細胞；糞便細菌培養：分離到痢疾桿菌；糞便免疫檢測：痢疾桿菌抗原陽性。 5.急性中毒型菌痢：起病急驟，突然高熱，反復驚厥，嗜睡、昏迷、迅速發生回圈衰竭和呼吸衰竭。腸道癥狀輕或缺如。 6.慢性菌痢：過去有菌痢病史，多次典型或不典型腹瀉兩個月以上。
三、結腸炎
(1)臨床方面：具有慢性腹瀉、粘液便、血便、腹痛，呈慢性反復性發作性或持續性，伴有不同程度的全身癥狀。少數患者僅有便秘或不出現血便。既往史體檢中要注意關節、口腔、眼、漿膜、皮膚、肝脾等腸外的臨床表現。
(2)乙狀結腸或纖維結腸鏡檢查可見：①受累結腸粘膜呈現多發性淺表潰瘍，伴有充血、水腫；病變多由直腸起始，往往累及結腸，呈彌漫性分布。②腸粘膜外觀粗糙不平，呈現細顆粒狀，組織脆弱易于出血，或可覆蓋有濃性分泌物，似一層薄苔附著。③結腸袋往往變平或變鈍，以至紐袋消失，有時可見到多個大小不等的假息肉。④結腸粘膜活檢病理變化呈現炎性反應，同時常可見到粘膜糜爛，隱窩膿腫，結腸腺體排列異常及上皮改變。
1、仔細詢問相關病史，收集相關臨床資料
2、密切對患者進行檢查，清楚了解患者的臨床癥狀
3、適當對患者進行相關的體格檢查，初步了解患者各器官的形態病變情況，特別注意腹部消化系統的疾病
4、對患者進行相關的器械檢查，適當進行實驗室檢查，糞常規的檢查一般都需要
5、綜合考慮各種檢查結果，結合各種器官損傷的臨床癥狀，最終得出相應診斷