電子式滅菌器根據采用的原理不同，可分為紅外加熱式滅菌器、電子式火焰滅菌器和電阻加熱式滅菌器。
1、紅外加熱式滅菌器
紅外加熱式接種環滅菌器，由外殼、陶瓷管、電熱絲、高溫石英管和溫度控制器等組成。陶瓷管為筒形，一端位于外殼頂端或側面上，另一端位于外殼內，陶瓷管的兩端分別裝有外爐蓋和內爐蓋，在內爐蓋的小圓孔內安裝有溫度傳感器，陶瓷管的外面纏繞著電熱絲，電熱絲的外面又包覆有云母帶，云母帶的外面還包覆了高溫航空棉。在所述的外殼后上部安裝有溫度控制器和顯3紅外加熱式滅菌顯示器；在溫度控制器與陶瓷管之間設有隔溫板。爐管內配有高溫石英管，以保證滅菌環境既衛生又安全。
2、電子式火焰滅菌器
電子式火焰滅菌器在歐美等發達國家的實驗室已被普遍使用。該滅菌器采用功能強大的微處理器控制，應用紅外感應器點火開關，當微處理器收到點火請求，即發出指令打開電磁閥，并在燃燒器頂部發出紅外熱能供消毒滅菌，溫度過高時微處理器即關閉電磁閥，滅菌器也會停止工作。電子式火焰滅菌器的面世，令長期以來實驗室常規火焰滅菌或灼燒用裝置所帶來的安全問題基本得以改善。
3、電阻加熱式滅菌器
各電阻加熱滅菌技術也叫歐姆滅菌，是一種利用接種環鉑絲橫截面小，電阻高的特點，借通入的電流使接種環內部產生的熱量而達到滅菌目的一種滅菌技術。電阻加熱式滅菌器構造相對簡單，主要提供正負兩極的接線柱用于滅菌。由于體積小，不耗氧，所以一般用于厭氧培養箱內使用。