揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用

　　Cell Research | 沈曉驊/孫育杰課題組合作揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用

　　哺乳動物基因組DNA全長近2

　　m，經過多層有序組織與折疊后分布于直徑5-10 μm的細胞核中。染色質高級結構對基因表達，細胞分化和胚胎發育起著至關重要的作用。其中，基因組A/B區隔化（A/B compartments）組織形式從纖毛蟲（ciliates）到人具有保守性，表明基因組內存在物種間高度保守的驅動力。

　　回歸基因組構成的本質，蛋白編碼區域只有不到2%，重復序列卻構成了人（Homo

　　sapiens）和小鼠（Mus musculus）超過一半的基因組，預示著基因組重復序列很有可能對染色質高級結構具有重要意義。LINE是人和小鼠基因組中豐度較高的一類逆轉錄轉座原件，分別占據人和小鼠基因組的17%和19%，主要包含了L1（又稱LINE1，LINE-1），L2和L3等類別，基因組中有超過500,000個L1的拷貝。

　　2020年初，清華大學醫學院的沈曉驊教授團隊對L1、B1/Alu等重復序列的功能做了前期探究。對人和小鼠基因組中重復序列在的分布、對基因的表達調控以及對染色質高級結構的影響等方面積累了一些實驗成果。