產前及產時感染由羊水或血性傳播，致病的微生物與宮內吸入污染羊水所致肺炎相仿，細菌感染以革蘭陰性桿菌較多見，此外有B組鏈球菌、沙眼衣原體、解脲脲原體及CMV(巨細胞病毒)等病毒。產后感染以直接接觸嬰兒者患呼吸道感染時易傳給新生兒；臍炎、皮膚感染和敗血癥時，病原體經血行傳播至肺而致肺炎；醫用暖箱、吸引器、霧化吸入器、氣管插管等消毒不嚴格，醫護人員無菌觀念不強、洗手不勤，輸入含有CMV、HIV等病毒的血制品等，均可致病。醫源性感染的高危因素：
①出生體重<1500g；
②長期住院；
③病房過于擁擠、消毒制度不嚴；
④護士過少；
⑤醫護人員無菌觀念差；
⑥濫用抗生素；
⑦使用呼吸機交叉感染；
⑧多種侵入性操作，氣管插管72小時以上或多次插管。病原體細菌以金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌為多見。許多機會致病菌如克雷白菌、銅綠假單胞菌、枸櫞酸桿菌、表皮葡萄球菌、不動桿菌在新生兒也可致病。我國近年來在肺炎和敗血癥新生兒中表皮葡萄球菌的陽性率不斷增加。另外，厭氧菌、沙眼衣原體、深部真菌感染呈上升趨勢，亦應引起重視。病毒以呼吸道合胞病毒、腺病毒感染多見，見于晚期新生兒。易發生流行，同時繼發細菌感染。出生后亦可發生CMV感染，病情比宮內感染輕。其他：如卡氏肺囊蟲、解脲脲原體、衣原體都可致肺炎。