制片
進行顯微鑒定，首先根據觀察的對象和目的，選擇具有代表性的生藥，制作不同的顯微制片，包括組織制片、表皮制片和粉末制片 。組織制片的方法主要有徒手制片、滑走制片、冰凍制片及石蠟制片等。對植物類中藥，如根、根莖、莖藤、皮、葉等類，一般制作橫切片觀察，必要時制縱切片；果實、種子類須制作橫切片及縱切片觀察；木類藥材須制作橫切片、徑向縱切片及切向縱切片三個面觀察。
表皮制片系將表皮細胞組織制成顯微觀察片的一種方法，適用于觀察葉片、花瓣、花萼和其它器官表皮的細胞形狀、氣孔、腺毛、非腺毛的類型和角質層的紋理以及各種細胞內含物等的顯微特征。粉末制片用于觀察藥材的組織、細胞及細胞后含物特征，制片時根據觀察目的物的不同可以選用斯氏液或水合氯醛制片。有時為了觀察某些細胞組織如纖維、石細胞、導管等，可制解離組織片。
顯微觀察與結果記錄
1. 組織特征的觀察與描述
組織特征特別是橫切面組織特征的觀察與描述，一般是由外向內依次進行，如雙子葉植物莖的初生構造由外向內依次為表皮、皮層和中柱三個部分。
在觀察與描述中，首先注意其各部分的位置、形態、有無其它組織分布等特征。其次應注意各種細胞及其內含物的顏色、形狀、大小。顏色是指在顯微鏡下所見到的顏色，描述方法同前已述及的性狀鑒定。形狀一般指在顯微切片中所見到的平面形狀。
大小指在顯微鏡下用目鏡測微尺測量的數據，一般取直徑（橢圓形、長方形均量短徑），如長度有鑒別意義，可加長度數據；導管、分泌細胞的直徑常指外徑；分泌腔、分泌道的直徑常指內徑；當目的物的大小差異很小時，可記載 1 個數字，如直徑約 50 μm ，當目的物的大小有一定差距時，可記載最小值與最大值，如直徑為 15~ 40 μm （ 50μm ），括號內的數字表示少數目的物的大小數字；若目的物的大小差距很大時，可記載最小值、常見值和最大值，如長 20~ 40 ~80μm 。
2. 粉末特征的觀察與描述
粉末制片在顯微鏡下觀察時，可見到多種組織碎片、細胞及內含物的特征。描述方法同上，在描述順序上，一般可以按照“先多后少”或“先特殊后一般”的原則進行。
3. 顯微測量
顯微測量是指在顯微鏡下用目鏡測微尺測量 細胞和后含物的大小。先將目鏡測微尺用載臺測微尺標化，計算出每一小格的 μm 數，應用時將測得目的物的小格數，乘以每一小格的 μm 數，即得所欲測定物的大小。測量微細物體時宜在高倍鏡下進行，因在高倍鏡下目鏡測微尺的每一格的 μm 數較少，測得的結果比較準確，而測量較大物體時可在低倍鏡下進行。
4. 結果記錄
顯微鑒定結果的記錄，除用文字來描述之外，均需附圖說明。附圖可以用顯微繪圖法繪制，也可以應用顯微攝影技術攝制。顯微攝影是利用顯微照相設備將顯微鏡下觀察的影像攝錄下來的一項技術。顯微照相設備種類很多，可分為無測光系統和有測光系統或自動、手動系統。
數碼顯微攝影技術是一項新的顯微攝影技術，其工作原理類似數碼相機，只是 CCD （ charge couple device ， 電荷耦合元件）直接安裝在顯微鏡上。數碼顯微攝影與普通顯微攝影是相似的，只是利用顯微鏡上方的 CCD 將顯微鏡下看到的圖像，轉變為數字信號輸出，通過相關的計算機圖像采集軟件直接在顯示器上顯示，使顯微鏡中觀察的圖像即時生成。目前計算機圖像采集軟件較多，一般多具有靜態圖 像 、動態圖像及連續圖像采集功能，數碼顯微攝影圖像清晰逼真，操作方便快捷，便于存儲與編輯，且還具圖像編輯、顯微測量功能