智能人工氣候室是理想的環境試驗設備，常用于種子發芽、育苗等項目，為農業育種研究帶來的作用“功不可沒”。因為設備能準確控制溫度、濕度、光照等參數指標，所以在使用智能人工氣候室的時候，最好能注意以下方面。
首先，我們要清楚的是，智能人工氣候室室內實際溫度與箱體顯示溫度和設定溫度之間都存在一定差異。箱體內實際溫度一般都小于箱體顯示溫度和設定溫度，在實際工作中需用溫度計來校正。樣品數量較少和做水稻發芽檢測等體積較小的實驗時，應該多使用容積較小、溫度較均勻的智能人工氣候室。
另外，當我們進行較多樣品實驗時，比如做玉米發芽試驗，或使用容積較大溫度難均勻的智能人工氣候室時，要特別注意兩點：
第一，玉米比一般作物需要的溫度較低，設定溫度也不宜太高，水稻等需較高溫度的樣品應盡量放置在箱體中部溫度較高的區域，以滿足試驗條件，促進生長發育。
第二，最上面的一層與最下面的一層都不要放置樣品。如果樣品數量較多且必須使用時，就一定要將最上一層和最下一層的樣品與中間溫度較高區域的樣品調換，這樣就可以促使各區域的樣品能同步發育，能夠在規定的天數內完成檢測。