近年來，大量種子檢驗儀器的應用，大大提高了種子檢驗的技術水平和育種的效率，促進了農業現代化的發展，不過種子檢驗的項目繁多，不同的檢測項目用到的檢測儀器也是不相同的，而智能種子計數系統作為其中重要的儀器產品，凡是需要進行種子技術的檢測項目，都可以使用它。
其中有兩個檢測項目中，智能種子計數系統的應用是比較頻繁的，我們知道要想獲得高產，除了要制定好的農藝措施，還需要提供優質的種子品種，而如何鑒定種子的好壞呢？其中的一種方法就是測定種子的千粒重，在這項測定項目中，就需要使用智能種子計數系統來進行種子計數，比如每份試樣大粒種子500粒，小粒種子1000粒，然后再稱取重量。
而另外一個檢測項目就是種子發芽率的測定，種子發芽率的測定是保證種子播種效果的一項重要措施，而種子的發芽率通常是按照百分比來進行測算的，因此這項檢測中也需要使用智能種子計數系統，數出一定數量的種子進行發芽試驗，然后再根據種子的發芽情況來進行測算。
過去，檢驗人員在遇到種子計數這項工作的時候，往往是愁眉苦臉的，因為這項工作不僅枯燥，而且麻煩，一不小心就很容易出現計數錯誤，而要重新開始，對操作者的耐心程度很有考驗，而現在使用智能種子計數系統，種子計數這樁麻煩事就變得輕而易舉了，使種子千粒重和發芽率等測定項目能夠準確、有序的開展下去，種子鑒定的效果明顯提高，為現代農業生產輸送了大量優質高產的種子品種。