最常見的模式生物有：逆轉錄病毒（retrovirus），大腸桿菌（Escherichiacoli），酵母（buddingyeast（Saccharomycescerevisiae），fissionyeast（Schizosaccharomyces pombe）），秀麗線蟲（Caenorhabditis elegans），果蠅（Drosophila melanogaster），斑馬魚（Danio rerio），小鼠（Musmusculus）等，
此外模式植物包括：擬南芥（Arabidopsis thaliana），水稻（Rice（OryzasativaL.））等。