林木種子儲藏如果保管不妥的話，就會影響發芽率，從而影響進一步的生產作業，以往由于儲藏環境不達標造成的林木種子損失是由發生，而現在人們利用林木種子標準樣品庫儲藏林木種子，取得了不錯的效果，不僅有效避免了林木種子損失，也最大程度保持了種子的發芽率。
與傳統的林木種子儲藏方式相比，林木種子標準樣品庫儲藏林木種子的優勢非常明顯，它屬于封閉的種子低溫低濕儲藏設備，因此在種子儲藏環境的控制方面會更加有優勢，也可有效避免外界環境對于林木種子的影響，而林木種子標準樣品庫儲藏林木種子的優勢總結起來，主要由以下幾點：
1.不會驟凍驟熱
林木種子標準樣品庫創造的環境是恒溫恒濕的低溫低濕環境，因此不會出現驟凍驟熱現象的發生，能夠避免溫度和濕度的突然變化對種子的影響。
2.不會接觸地面
使用林木種子標準樣品庫儲藏林木種子，可以避免種子直接接觸地面，沒有受潮的風險。
3.避免煙熏藥熏
林木種子標準樣品庫創造的低溫低濕環境并不適合種子害蟲的生存，因此在這樣的環境下，可以不用擔心害蟲對林木種子的侵害，也免除了煙熏藥熏這一步驟，從而避免了藥熏對種子發芽率和發芽勢的影響。
4.避免水分過多
一般來說種子含水量越多，呼吸強度越大，消耗養分越多，種子出苗越弱。而林木種子標準樣品庫屬于封閉的儲藏空間，能夠有效避免種子吸潮所導致的種子含水量增加的風險，使種子始終維持在較低的呼吸作用下，有助于提高來年播種的品質。