一、顯微切割中期染色體的制備
1.取0.5mL外周血與含PHA的4.5mLRPMI1640培養液混合,在37℃培養細胞64?68h。
2.收獲細胞前20min在培養基中加入25ml秋水仙胺(10μg/mL),繼續在37℃培養。
3.將細胞培養物移至15mL離心管中250g離心5min,然后小心棄上清。
4.用10mL低滲液重懸細胞沉淀,37℃水浴中溫育12?18min,250盡離心5min,棄上清。
5.用8mL新鮮配制的Camoy固定液輕柔地重懸細胞,將試管放置冰中至少2h,250g離心5min,然后小心棄上清。
6.用5mL固定液洗細胞2次,250g離心5min。
7.用0.5?1.5mL固定液重懸細胞,獲得有點不透明的懸液用于滴片。
8.滴2或3滴細胞懸液在干凈的呈45°角傾斜的蓋玻片上,隨液體的流動鋪勻整張片子,不要吹片子避免污染。
9.將片子在37℃無菌容器中可放置3?5d備用。
10.在顯微切割前完成用胰蛋白酶-Giemsa處理的標準G帶。用胰蛋白酶工作液在室溫中處理1?2min/將片子移至室溫條件下的Giemsa工作液5min,然后用蒸餾水漂洗片子,氣干。
二、顯微切割和拓撲異構酶I處理
1.在倒置顯微鏡下找到靶染色體,該顯微鏡有可隨意轉動的載物臺,以使靶染色體垂直于玻璃針的移動軸。如果可能,顯微鏡應放在防震的臺面上以減少振動。
2.用固定在顯微鏡上的顯微操作裝置控制的玻璃針切割靶染色體區域。
3.將玻璃針的針尖放置在靶DNA片段的正上方,然后向下移動玻璃針輕輕觸及該片段。利用靜電的力量將DNA片段吸到針尖,然后移動針尖到5μL收集液中。
4.在收集到預期數量(5拷貝)的切割DNA片段后,滴一滴礦物油覆蓋在收集液上。在顯微切割的DNA擴增前,用拓撲異構酶I 37℃處理1h使結構非常緊密的DNA解旋。
三、擴增切割的DNA
1.進行PCR啟動程序(5?8個循環,94℃、1min,30℃、2min,37℃、2min),在每個循環的30℃時加入約0.3U的測序酶(13U/mL的測序酶用酶稀釋緩沖液稀釋1?8倍,在5μL的反應體系中加入0.2PL測序酶稀釋液)。
2.完成上述預擴增步驟后,在同一PCR管中進行Taq酶參與的常規PCR反應,PCR體系為50μL,PCR反應條件:94℃、1min,56℃、1min,72℃、1.5min的30循環,最后在72℃延伸5min。
3.加2μL第一輪PCR產物到另一個50μPCR反應體系中,進行20個PCR循環,反應條件同步驟2。
4.可用電泳分析識別處理的是否成功,將5μLPCR產物在1%瓊脂糖凝膠上電泳。PCR產物的大小范圍應在200?800bp。
四、熒光原位雜交
1.制備FISH探針,加2μL第二輪的PCR產物到與上述步驟相同的50μLPCR反應體系(除了加入終濃度為ZOμmol/L生物素-16-dUTP外)中,繼續PCR反應20個循環:.94℃、1min,56℃、1min,72℃、2min,最后在72℃延伸5min。
2.按照產品說明的步驟用B10-gel P6過濾柱上離心PCR產物,以去除未摻入生物素-16- dUTP。
3.用1/10體積3mol/L乙酸鈉和2倍體積乙醇在4℃沉淀探針20min。4℃條件下用10000g離心15min,用40μL TE緩沖液重懸探針。
4.FISH探針雜交是基于以前介紹的操作步驟基礎上。簡言之,對于每個雜交反應,大約100ng標記的探針混合于10μL雜交緩沖液(7μL雜交混合液、2μL探針和1μL人Cot1-DNA)中,在75℃變性5min,接著在37℃預雜交20min。
5.中期染色體標本需在72℃變性液中變性2min,然后將標本用70%、85%和100%的乙醇系列脫水。
6.將含有探針的雜交緩沖液滴在變性后的片子上,蓋上22mmX22mm蓋玻片,用橡皮膠封片。移至37℃濕盒中雜交過夜。
7.雜交完成后,移去蓋玻片,將片子用45℃洗液I洗3次,每次5?10min。
8.室溫下用洗滌液II洗3次,用洗滌液III洗1次,每次2min。
9.只含有直接標記探針的雜交可在此時進行分析。用生物素標記探針的雜交,用40μL含5μg/mL FITC-親和素的PNM緩沖液室溫處理20min。然后按步驟8洗滌標本。
10.染色體標本經40斗含5μg/mL抗親和素抗體的PNM緩沖液室溫處理20min,將熒光信號放大;然后按步驟8洗滌標本。
11.染色體標本通常用另一層的FTTC-親和素處理,處理條件同步驟9。
12.染色體標本經過70%、85%和100%乙醇系列脫水,空氣中干燥。用40μL含DAPI(1μg/mL)的抗淬滅劑液復染,蓋上蓋玻片,用裝有合適濾光片的熒光顯微鏡進行觀察 收起 |