柯薩奇病毒是一種腸病毒，分為A和B兩類，一般在夏秋季呈流行或散在發生，傳播途徑是經消化道、呼吸道，亦可通過血行經胎盤傳播給胎兒。病毒開始在腸道、上呼吸道的內皮細胞和淋巴組織內復制，經血行傳播，其親嗜性靶器官為中樞神經系統，心臟、血管內皮細胞、肝、胰、肺、生殖器官、骨骼肌、皮膚黏膜等。
柯薩奇病毒經糞-口呼吸道蟲媒傳播感染人類，進一步形成病毒血癥，體內任何臟器均可受累，主要靶器官是腦膜、心臟、皮膚、肌肉等。
