在大型的rDNA序列,rDNA的重復單元之間的多態性非常低,這表明rDNA的串聯陣列通過協同進化演變。在對9種果蠅的5S串聯重復序列區域彼此進行比較后得出的結果表明,因這一區域插入和刪除較為頻繁,在5'端以及3'端兩側發現有保守序列。他們可能在DNA復制或通過基因轉換的過程中發生新合成鏈的滑移。