1.血清抗體檢測
主要有微量免疫熒光試驗、酶聯免疫吸附試驗等。檢出高滴度的抗沙眼衣原體對診斷該病有重要意義。
2.衣原體培養、抗原檢測法、核酸檢測法
衣原體培養是診斷該病最特異的方法，但敏感性不太高。抗原檢測法如酶免疫法較為簡便、快速，但敏感性也不高。核酸檢測法十分敏感和特異，也可用于該病的實驗室檢查。
3.組織病理學檢查
有該病的相對特異的組織病理學改變，在診斷上有一定的參考價值。
必須指出的是：臨床上即便是該病的診斷確立，也應做梅毒、生殖器皰疹、軟下疳等潰瘍性疾病的實驗室檢測，以排除合并這些感染的可能。