經原生質體培養的植株再生一般經過細胞壁再生，細胞分裂成細胞團、愈傷組織（或胚狀體）、植株再生這幾個過程。
①細胞壁再生：原生質體在合適條件下短時間內開始膨脹，葉綠體重排，并開始合成新的細胞壁，進而由球形變成橢圓形。
②細胞分裂：不同的植物細胞分裂時間不同。為了細胞能持續分裂，應注意及時添加新鮮培養液。
③愈傷組織：細胞不斷分裂形成細胞團，并進一步形成愈傷組織。一些植物由細胞系形成胚狀體。愈傷組織誘導：在合適的培養基，通過調節生長素和細胞分裂素的比例。
④植株再生，誘發芽和根的生成。 誘導胚狀體：在原生質體培養時直接誘發胚狀體的生長，從而發育成完整植株。