植物凝集索由于專一的識別某一特定單糖或多糖中的特定糖基序列，不僅用于分離純化，也用于糖鏈的結構分析。它們可識別糖鏈的不同類型、不同核心結構，探測糖鏈分布，選用多種凝集索反復核對糖鏈的結構可獲得較為準確的結論。利用凝集素親和層析。
親和電泳和抗體凝集素酶免疫測定凝集素和糖鏈結合的強弱。細胞表面的糖鏈結構因細胞種類、分化階段或功能狀態而異，因此可以利用凝集素分離無損傷，高存活率，高產量的特定結構細胞亞群。在免疫學上植物凝集索還是不可缺少的促淋巴細胞有絲分裂劑。在神經學科上，研究神經元表面結構，外周神經元損傷帶來的后果及其修復機制，細胞神經遞質受體等。