一、原理
DNA多態性是指DNA堿基順序的差異性。這種差異性不僅存在于不同的植物之間，也存在于同一種植物的不同個體之間。RFLP多態性是指DNA限制性內切酶酶切片段長度的多態性(restniction
fragment length
olymophorphism)。由于堿基順序的差異，在不同的種或同一個種的不同個體之間，它們的基因組DNA限制性內切酶位點的種類和數目不同，經特定的限制性內切酶切割后，所產生的限制性酶切片段在大小（長度）和數目方面自然也存在著差異。通過瓊脂糖凝膠電泳分離和溴化乙錠染色，在紫外檢測儀下觀察，即可直接看到這種差異。電泳分離后，通過Southern雜交也可顯示出已知DNA片段的差異。
二、目的
通過本實驗了解不同植物或同一植物不同個體之間基因組DNA順序的差異性，掌握DNA限制性酶切片段長度多態性研究的基本方法。
三、材料和試劑
1、從不同植物或同一植物不同個體分離出的基因組DNA。
2、限制性內切酶。
3、10×限制性內切酶緩沖液。
4、0.5M EDTA(pH 8.0)
5、溴化乙錠。
6、瓊脂糖。
7、電泳儀和電泳槽。
四、操作步驟
（一）限制性內切酶酶切。
1、將在-20℃冷凍的DNA在冰上融化。
2、取8支微量離心管按下表所示作好標記
，并依次加入所需成分。
| 品種I | 品種II | 品種I－1 | 品種II－2 | |||||
| 單酶切 1# | 雙酶切 2# | 單酶切 3# | 雙酶切 4# | 單酶切 5# | 雙酶切 6# | 單酶切 7# | 雙酶切 8# | |
| DNA | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 |
| 10×緩沖液 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 |
| Eco R I | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |
| Hind III | 1 | 1 | 1 | 1 | ||||
| 無菌水 | 7 | 6 | 7 | 6 | 7 | 6 | 7 | 6 |
| 總體積(ul) | 20 | 20 | 20 | 20 | 20 | 20 | 20 | 20 |
3、混勻，慢速離心2秒，使溶液全部聚于管底。
4、37℃保溫2－3小時。
5、加入1／10體積的0.5M EDTA溶液終止反應。
（二）瓊脂糖凝膠電泳分析
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