MEN-ⅡB綜合征突出的癥狀是大多數(非全部)有粘膜神經瘤.神經瘤外表像發光小腫瘤,分布在唇,舌和口腔粘膜上.眼瞼,鞏膜和角膜亦常累及.厚眼瞼和彌漫性增厚口唇是特征.與胃腸道運動異常的癥狀(便秘,腹瀉和偶見巨結腸)常見,這是由于彌漫性腸道神經節瘤所致.雖然神經瘤面部特征和胃腸道病變早期就存在,但診斷綜合征常常在晚年甲狀腺髓樣癌或嗜鉻細胞瘤出現以后.除了馬方樣體態,脊椎骨骼異常(前突,后突,側突),弓形足,足馬蹄內翻常見.
約一半報告的病例示完全綜合征,有神經粘膜瘤,嗜鉻細胞瘤和甲狀腺髓樣癌.＜10%病人有神經瘤和嗜鉻細胞瘤,而其余有神經瘤和甲狀腺髓樣癌無嗜鉻細胞瘤.
甲狀腺髓樣癌和嗜鉻細胞瘤很像MEN-ⅡA綜合征中的相應疾病,兩者傾向雙側和多中心.然而,甲狀腺髓樣癌在MEN-ⅡB綜合征中特別傾向侵犯性,可見于很年幼兒童.