奈韋拉平是肝細胞色素P450代謝酶(CYP3A，CYP2B)的誘導劑，其它主要由CYP3A，CYP2B代謝的藥物在與奈韋拉平合用時，奈韋拉平可以降低這些藥物血漿濃度(參見藥物代謝動力學)。因此，如果一個患者正在接受由CYP3A或CYP2B代謝的藥物的一個穩定劑量的治療，若開始合用奈韋拉平，前者藥物劑量需要調整。
核苷類逆轉錄酶抑制劑：
當奈韋拉平與疊氮胸苷(zidovudine)，didanosine或zalcitabine合用時，不需調整這些藥物的劑量。從兩組以疊氮胸苷(zidovudine)治療為背景治療的研究中(n=33)，可得到疊氮胸苷(zidovudine)的綜合數據，其中HIV-1感染的患者單獨接受奈韋拉平(400mg/天)治療，或奈韋拉平合用didanosine(200～300mg/天)或奈韋拉平合用zalcitabine(0.375～0.75mg/天)的治療，試驗結果奈韋拉平對疊氮胸苷藥時曲線下面積(AUC)的下降無顯著作用，為13%；對疊氮胸苷Cmax上升無顯著作用，為5.8%。疊氮胸苷(zidovudine)對奈韋拉平的藥動學無影響。另一交叉研究表明奈韋拉平對didonosine(n=18)或zalcitabine(n=8)的穩態藥代動力學均無影響。
對25例HIV感染的患者，應用奈韋拉平、nelfinavir(70mgtid)和stauvdine(30-40mgbid)治療36天的臨床試驗結果顯示，stauvdine的AUC或Cmax無統計學顯著變化。另外，對90名接受lamivudine加奈韋拉平和另一組是奈韋拉平加安慰劑治療的患者進行人群藥代動力學研究，結果顯示lamivudine表觀清除率和分布容積無改變。這表明奈韋拉平對lamivudine的清除無影響。
非核苷類逆轉錄酶抑制劑：臨床試驗(14例)結果顯示，奈韋拉平與efavirenz合用不影響奈韋拉平穩定狀態藥代動力學參數。但是，efavirenz與奈韋拉平合用其藥物濃度顯著下降。 efavirenz的AUC下降22%，Cmax下降36%。如果與奈韋拉平合用要保證efavirenz每天的用量增加到800mg。
蛋白酶抑制劑：以下試驗中，奈韋拉平用藥方法按照200mg每日一次，共兩周。之后，200mg每日兩次，共28天。
Saqinavir：一項臨床試驗(31例)中，HIV感染的患者服用奈韋拉平和saqinavir(硬膠囊，600mg，每日三次)。結果表明二者合用導致saqinavirAUC平均下降24%(P=0.041)，但奈韋拉平血漿濃度無明顯變化。由于相互作用，導致saqinavir硬膠囊AUC下降，可能進一步引起saqinavir血漿濃度下降，兩者相互作用的臨床意義尚不清楚。聯合用藥不影響奈韋拉平的藥代動力學。
另外一項臨床試驗(20例)研究了每天一次服用saqinavir軟膠囊和100mg ritonavir。所有的患者都同時服用奈韋拉平。研究結果表明與歷史對照相比，saqinavir軟膠囊和100mgritonavir合用不影響奈韋拉平的藥代動力學參數。saqinavir軟膠囊和100mg ritonavir合用對奈韋拉平藥代動力學影響在臨床上沒有顯著性。
Ritonavir：當奈韋拉平與ritonavir合用時，不需調整劑量。臨床試驗(n=25)表明HIV感染患者同時接受nevirapine和ritonavir(600mg，每日兩次，〔采用劑量漸增的用藥方案〕)治療，兩者血漿濃度均無明顯變化。
Indinavir：臨床試驗(n=25)表明HIV感染患者接受奈韋拉平和indinavir(800mg，8小時一次)治療，indinavirAUC平均下降28%(P[0.01)，而奈韋拉平血漿濃度無明顯變化。對于奈韋拉平和indinavir合用的潛在相互影響，還沒有肯定的臨床結論。奈韋拉平與indinavir合用時，當奈韋拉平劑量為200mg，每日兩次時，indinavir劑量可考慮增加到1000mg，每八小時一次。但是，目前尚無資料顯示給予indinavir1000mg，每八小時一次，加奈韋拉平200mg，每日兩次與indinavir 800mg，每八小時一次，加奈韋拉平 200mg，每日兩次，兩方案的短期或長期抗病毒作用有何不同。
Nelfinavir：一項36天的臨床試驗(n=25)表明：應用奈韋拉平，nelfinavir(75mg，每日三次)和d4T(30～40mg，每日二次)的HIV感染患者，在合用奈韋拉平后，nelfinavir藥代動力學參數沒有統計學上顯著變化(AUC+4%，Cmax+14%和Cmin-2%)。與以前的