泊沙康唑主要通過UDP葡糖苷酸化進行代謝，并且是p糖蛋白（P-gp）泵出作用的底物。因此，這些清除途徑的抑制劑或誘導劑可對泊沙康唑的血漿濃度產生影響。泊沙康唑也是CYP3A4的強效抑制劑。因此泊沙康唑可以增加主要通過CYP3A4代謝的藥物的血漿濃度。
1、通過CYP3A4代謝的免疫抑制劑
西羅莫司：泊沙康唑與西羅莫司聯合用藥可導致西羅莫司血液濃度約升高9倍，從而會導致西羅莫司中毒。因此禁止泊沙康唑與西羅莫司聯合使用。
他克莫司：泊沙康唑可導致他克莫司的Cmax和AUC值顯著增加。在開始泊沙康唑治療時，將他克莫司的劑量減至初始劑量的約三分之一。在泊沙康唑治療期間和停止治療后應該頻繁監測他克莫司的全血濃度谷值，并且依據此調整他克莫司的劑量。
環孢菌素：在開始泊沙康唑治療后，心臟移植患者的環孢菌素全血濃度升高。建議在開始泊沙康唑治療時，將環孢菌素的劑量減至初始劑量的約四分之三。在泊沙康唑治療期間和停止治療后應該頻繁監測環孢菌素的全血濃度谷值，并且依據此調整環孢菌素的劑量。
2、CYP3A4底物
泊沙康唑與CYP3A4底物，如匹莫齊特和奎尼丁聯合用藥可導致上述藥品的血漿濃度升高，從而導致QTc間期延長和罕見的尖端扭轉型室性心動過速。因此，禁止泊沙康唑與這些藥物聯用。
3、通過CYP3A4代謝的HMG-CoA還原酶抑制劑（他汀類藥物）
泊沙康唑與辛伐他汀聯合用藥可導致辛伐他汀血漿濃度約升高10倍。因此，禁止泊沙康唑與HMG-CoA還原酶抑制劑辛伐他汀聯用。
4、麥角生物堿
大多數麥角生物堿都是CYP3A4底物。泊沙康唑會導致麥角生物堿（麥角胺和雙氫麥角胺）血漿濃度升高，可能導致麥角中毒。因此，禁止泊沙康唑與麥角生物堿聯用。
5、通過CYP3A4代謝的苯二氮卓類藥物
泊沙康唑與咪達唑侖聯合用藥會導致咪達唑侖血漿濃度約升高5倍。而咪達唑侖血漿濃度升高則會增強并且延長催眠和鎮靜作用。泊沙康唑與其他通過CYP3A4代謝的苯二氮卓類藥物（例如，阿普唑侖、三唑侖）聯合用藥會導致這些苯二氮卓類藥物血漿濃度升高。必須密切監測治療患者是否發生由于通過CYP3A4代謝的苯二氮卓類藥物血漿濃度過高導致的不良反應，并且必須備有苯二氮卓受體拮抗劑用于逆轉這些反應。
6、抗HIV藥物
依法韋侖：依法韋侖可誘導UDP-葡糖苷酶，并且顯著降低泊沙康唑血漿濃度。除非獲益超過風險，否則推薦避免依法韋侖與泊沙康唑聯用。
利托那韋和阿扎那韋：利托那韋和阿扎那韋通過CYP3A4代謝，而泊沙康唑會導致這些藥物的血漿濃度升高。在與泊沙康唑聯合使用期間，應該頻繁監測不良反應和毒性，并且對利托那韋和阿扎那韋進行劑量調整。
7、利福布汀
利福布汀可誘導UDP-葡糖苷酶，并且降低泊沙康唑血漿濃度。利福布汀也通過CYP3A4代謝。因此，利福布汀與泊沙康唑聯合用藥會導致利福布汀血漿濃度升高。除非對患者的獲益超過風險，否則應避免泊沙康唑與利福布汀聯用。然而，如果需要聯合用藥，由于利福布汀血漿濃度會升高，推薦對突破性真菌感染進行密切監測，并且頻繁監測全血計數和不良反應（例如，葡萄膜炎、白細胞減少癥）。
8、苯妥英
苯妥英可誘導UDP-葡糖苷酶，并且降低泊沙康唑血漿濃度。苯妥英也通過CYP3A4代謝。因此，苯妥英與泊沙康唑聯合用藥會導致苯妥英血漿濃度升高。除非對患者的獲益超過風險，否則應避免泊沙康唑與苯妥英聯用。然而，如果需要聯合用藥，推薦在與泊沙康唑聯用時對突破性真菌感染進行密切監測，頻繁監測苯妥英濃度，并且考慮降低苯妥英的劑量。
9、胃酸抑制劑/中和劑
西咪替丁（H2受體拮抗劑）和艾美拉唑（質子泵抑制劑）可導致泊沙康唑血漿濃度降低。除非獲益超過風險，否則推薦避免西咪替丁和艾美拉唑與泊沙康唑聯用。然而，如果需要聯合用藥，推薦對突破性真菌感染進行密切監測。在泊沙康唑與除西咪替丁外的抗酸劑和H2受體拮抗劑聯用時，沒有發現臨床相關影響。泊沙康唑與除西咪替丁以外的抗酸劑和H2受體拮抗劑聯用時，無需調整泊沙康唑劑量。
10、長春生物堿
大多數長春生物堿都是CYP3A4底物。泊沙康唑可導致長春生物堿（如長春新堿與長春堿）的血漿濃度升高，從而導致神經毒性。因此，推薦考慮對長春生物堿進行劑量調整。
11、通過CYP3A4代謝的鈣離子通道阻滯劑
泊沙康唑可能導致通過CYP3A4代謝的鈣離子通道阻滯劑的血漿濃度升高（例如，維拉帕米、地爾硫卓、硝苯地平、尼卡地平、非洛地平）。在聯合治療期間，建議頻繁監測鈣離子通道阻滯劑相關的不良反應和毒性。可能需要降低鈣離子通道阻滯劑的劑量。
12、地高辛
在接受地高辛與泊沙康唑聯合治療的患者中，報告地高辛血漿濃度升高。因此，在聯合治療期間，建議對地高辛的血漿濃度進行監測。
13、胃腸動力藥
甲氧氯普胺可導致泊沙康唑血漿濃度降低。如果同時使用甲氧氯普胺，建議對突破性真菌感染進行密切監測。
洛哌丁胺不會影響泊沙康唑血漿濃度。洛哌丁胺和泊沙康唑聯用時，無需對泊沙康唑進行劑量調整。
14、格列吡嗪
盡管泊沙康唑與格列吡嗪聯合用藥時，不需要對格列吡嗪進行劑量調整，不過推薦對葡萄糖濃度進行監測。