1.眼部表現
據報道，炎性腸病出現眼病表現的發生率為1.9%～11.8%。最常見的眼部表現是鞏膜外層炎、前葡萄膜炎角膜炎和鞏膜炎。伴有關節炎和其他腸外病變如貧血、皮膚損傷、肝疾病口腔潰瘍的CD或UC更易于罹患眼病。如在CD患者，伴有結腸炎或回結腸炎的患者比僅有小腸病變的患者更易于發生眼病。
2.非眼部表現
以胃腸道和關節病變最常見。CD患者的胃腸道癥狀有因痙攣便秘、部分或完全性腸梗阻引起的臍周腹右下1/4絞痛，并伴有腹瀉、惡心、嘔吐、發熱、食欲不振和體重減輕若潰瘍病變穿孔至腸外組織或器官，可形成瘺管。UC患者為下腹或腹左下1/4痙攣性疼痛，較輕，有疼痛-便意-便后緩解的規律。因炎癥刺激使腸蠕動增加及腸腔水、鈉吸收障礙，可產生脫水和電解質失衡的復發性黏液膿血性腹瀉。
兩病的周圍關節炎在腸道疾病發作6個月至幾年后，偶爾也可在結腸炎之前發生或同時發生。一般急性發作，常為不對稱形式，侵及1個或幾個大關節最常受累的是膝踝等負重關節表現腫脹、紅斑滑膜液分析呈炎癥性，通常可在幾周內痊愈不留后遺癥其他可能侵及的關節有末端指間、肘、肩和腕關節。關節炎常出現在腸道炎癥嚴重、范圍廣泛的患者。
3.患者其他的全身性表現
包括失血或失蛋白引起的貧血、肝、膽并發癥（如膽鹽吸收不良的膽結石、繼發性營養不良、糖皮質激素治療或從深靜脈高營養液補充過多的碳水化合物所致的肝臟脂肪變性、膽管炎和肝功能異常）血栓性靜脈炎等。生殖泌尿系異常如腎結石是IBD的常見表現因脂肪瀉使草酸鹽和草酸鈣結合引起，CD形成的瘺管常有膀胱瘺，炎癥性包塊機械性壓迫導致輸尿管阻塞等。IBD患者還可發生骨質疏松和骨軟化等代謝性骨病。