1.外傷性眼內炎：患者有明確的外傷或手術史，臨床表現隨感染發作的快慢和程度有所不同。一般情況下，大多數細菌性眼內炎患者起病急驟，傷眼的疼痛明顯加重，畏光流淚，視力驟降，甚至無光感，眼瞼痙攣，結膜水腫、充血，結膜囊的黃色分泌物增多，玻璃體混濁。可有明顯的眼瞼水腫，不易睜開。角膜有不同程度的水腫，KP（角膜后沉著物），傷口可能會裂開，嚴重者有分泌物從傷口流出。前房內蛋白及細胞增多，下部常有積膿，有時前房積膿混有血液。極重時，前房內出現血性滲出物，角膜變白。如有人工晶狀體，前后面都有纖維蛋白性膜。玻璃體內有大量細胞碎片，局部有白色的團狀或成層的混濁。眼壓可能降低，但也可為正常或偏高。瞳孔縮小，眼底難以檢查。視網膜血管炎屬于感染早期的表現，在多數病例看不清楚。通常眼底僅有紅光反射或完全無反射。由表皮葡萄球菌或其他凝固酶陰性菌引起者，臨床發作可在傷后幾天，表現較輕。
2.內源性細菌性眼內炎：常見于急性感染性疾病（敗血癥等）、慢性全身性疾病（如糖尿病、慢性腎衰等）、惡性腫瘤、免疫功能缺陷、長期服用免疫抑制劑或糖皮質激素的患者，出現突然的視力下降，眼痛，畏光流淚。裂隙燈顯微鏡下可見球結膜充血及水腫，角膜基質水腫，后彈力層皺褶，角膜后沉著，前房閃輝或積膿，瞳孔傳入阻滯以及晶狀體或人工晶狀體表面見滲出物等炎癥的表現。眼底檢查可見玻璃體混濁、視網膜血管收縮、眼底出血斑和白色或黃色的結節狀浸潤病灶。個別嚴重的患者可發展為全眼球炎，近而出現眼球突出、眼瞼和眼肌運動障礙。
3.真菌性眼內炎：多見于藥物成癮、免疫功能障礙或長期體內帶導管的患者。起病慢，自覺癥狀較輕，一般可有患眼疼痛，視力下降，眼前漂浮物，輕度睫狀充血和少量前房積膿，玻璃體滲出等，常為雙側。脈絡膜及視網膜可出現分散的、多灶性、黃白色病灶，逐漸發展為數個視盤大小的絨狀病變。隨著病情的發展病變面積增大，進一步播散至玻璃體腔形成“棉球狀”病灶。