早在1940年，遺傳學家發現在人類的智力低下患者發病率，男性總是比女性來的高。因此開始懷疑這種智力低下可能與X染色體有關，因為男性只有一個X染色體，而女性通常是兩個X染色體。到了1969年前后，終于發現了一個典型的智力低下患者家系。在這個家庭里的兩個男孩都表現出智力低下。染色體分析發現他們的細胞內唯一的X-染色體均有別于正常男人的X-染色體，表現在X染色體的長臂末端出現“縊溝”。這種患者的細胞在缺乏胸腺密啶或葉酸的環境中培養時，往往會出現X-染色體在“縊溝”處發生斷裂。根據這些結果，首次命名為“脆性X染色體綜合征(Fragile X syndrome)”。