1. HLA-B27結構與角色
1968年Dr.Eric Thorsby發現HLA-B27,
1973年發現HLA-B27與AS有強烈的關聯性，據統計，95%的患者具有HLA-B27抗原(即HLA-B27陽性)；所有HLA-B27(+)的人，有2-10%終將發展成AS。除了HLA-B27外，B7, B22, B40, BW42等與AS也有弱關聯性.已經分析出HLA-B27的結構及氨基酸序列，并證實HLA-B27分為至少七種亞型(5,17) 。 發現B27結構上有一「凹槽」,就是B27與抗原結合之處，是決定抗原性的重要關鍵。
2. 與微生物的關系
AS發病與否，與細菌造成的胃腸道或泌尿道感染關系密切。細菌感染，常常使得B27陽性的人發病，或已發病的人惡化。很多學者發現：有些細菌（如Klebsiella, Yersinia, Shigella spp.）的片段結構與B27結構上的「凹槽」有相似之處，或許因而讓免疫細胞「誤認」！----誤認自己身上的正常細胞的B27（正常細胞都有B27）為入侵的細菌，因而引發自體免疫疾病。這就是所謂的【分子相似學說】(Molecular mimicry theory)。
3.致關節炎抗原學說
當某些外來的細菌侵入人體後，會在關節等處產生一些「抗原」(可能是細菌的片段或代謝產物)。這些「抗原」可以與B27結合，并使得此結合後的復合體(B27+抗原)變成被免疫細胞攻擊的目標，因而引發一連串的免疫反應---此即「致關節炎抗原學說」(Arthritogenic peptide theory)。
4.動物實驗模型
利用轉基因技術，研究者可以將人類的HLA-B27植入老鼠體內的基因，這種轉基因鼠(Transgenic mice)經過暴露於某些環境因素(如細菌感染)之後，也像人類一樣會產生類似脊柱炎的癥狀，因此提供了一個很好的動物研究模型，有助於了解強直性脊柱炎的致病機制。