化學法制備D-阿洛酮糖由于產物純化步驟繁復、化學污染嚴重和副產物雜多等原因,尚未取得突破性進展。1990年,日本香川大學（Kagawa University）Izumori團隊發現,產堿桿菌屬細菌A1caligenes sp.可以生產D-阿洛酮糖,開辟了生物法制備D-阿洛酮糖的先河。生物轉化方法因反應單一、純化步驟簡單等優點,逐漸成為生產D-阿洛酮糖的主要策略。其中,酮糖3-差向異構酶作為D-阿洛酮糖生物轉化的重要催化劑,可催化D-果糖與D-阿洛酮糖（圖2）及D-塔格糖與D-山梨糖之間的相互轉化。不同微生物來源的異構酶具有不同的底物特異性,主要分為：D-塔格糖3-差向異構酶（D-tagatose 3-epimerase,DTEase）和D-阿洛酮糖3-差向異構酶（D-psicose 3-epimerase,DPEase）。表1總結了不同菌株來源酮糖3-差向異構酶的反應情況。