①物種形成是基本的進化過程，也是生物多樣性形成的基礎。自然選擇可以導致新物種的產生。生態物種形成是指以生態為基礎的歧化選擇使不同群體分化產生生殖隔離的物種形成過程。歧化選擇的來源主要包括不同的環境或生態位、不同形式的性選擇，以及群體間的相互作用。生殖隔離的形式多種多樣，我們總結了合子前和合子后隔離的遺傳學機制以及在生態物種形成中起到的作用。控制適應性性狀的基因與導致生殖隔離的基因可以通過基因多效性或連鎖不平衡相互關聯起來。借助于第二代測序技術，研究者可以對生態物種形成的遺傳學與基因組學基礎進行研究。此外，本文還總結了生態物種形成領域最新的研究進展，包括平行進化的全基因組基礎，以及基因流影響群體分化的理論基礎。通過歸納比較由下至上和由上至下這兩種不同的研究思路，相關研究學者認為這兩種思路的結合可以為生態物種形成基因的篩選提供更有力也更精確的方法。同時，相關研究學者還提出生態物種形成的研究應該基于更好的表型描述以及更完整的基因組信息，研究的物種也應該具有更廣泛的代表性。
②生物群體的變異性是有機體所有類群的一個屬性。在本世紀的二十年代至四十年代，植物進化研究的一個重要的目的是了解種內和群體內存在的復雜的變異式樣。近一、二十年來，進化生物學研究工作的一個重要的方面已轉移到生態因素對個體、群體和種在環境和生物兩方面的效應以及這些效應在生態學、分類學和進化中實際的含義上來。種內變異的描述和分類已成為當前最有挑戰性的問題和最值得探索的領域之一。可塑性和耐受性在有花植物中普遍存在。但對大多數種來說，可塑性是有限的：一個具有較大分布區的種的不同地區的群體往往具有不同的基因型，而這些基因型是遺傳和生態兩個因素之間長時期復雜的相互作用的產物。種內變異是生態型性質還是梯度變異性質取決于自然界不同氣候帶或氣候條件之間是急劇過渡還是逐漸過渡。但土壤和生物因素有時也參與宗的分化。群體和種內的變異不一定都有外部形態的變化，而是在多數情況下表現為生理和生化的差異。適應于富含鋁、銅或鋅等重金屬鹽的土壤的小地理宗是由足夠強大的歧化選擇而不是由內在的隔離機制來維持。多態現象，即群體內不同遺傳變異體的頻率變化，可能與自然選擇有關。