敗血癥患者最顯著的病理變化是組織器官細胞變性、微血管栓塞、組織壞死與出血。除肺、腸、肝、腎、腎上腺等具有上述病變外,心、脾也常被波及。繼發性膿胸、化膿性心包炎、腹膜炎、腦膜炎及急性心內膜炎等合并癥都較多見。