陰道毛滴蟲病由有鞭毛的梨狀原蟲陰道滴蟲侵入陰道而發病。陰道毛滴蟲首先由Donne（1836）在婦女陰道分泌物中發現，本蟲與人毛滴蟲、口腔毛滴蟲一樣均只有滋養體而無包囊期。典型者為梨形或卵圓形，大小 9.7（4.5～19）μm×7（2.5～12.5）μm。借其前端四根鞭毛擺動前進，并以波動膜波動作螺旋式運動。
陰道毛滴蟲適宜在溫度25～40℃、pH為5.2～6.6的潮濕環境中生長，在pH5以下或pH7.5以上環境中不生長。本蟲屬兼性厭氧寄生，適應寄生在相對缺氧的陰道內并能迅速繁殖，主要寄生在陰道，還常侵入尿道或尿道旁腺，甚至膀胱、腎盂等。在男性泌尿生殖系統則以前列腺最為常見，也可寄生在尿道或包皮皺褶。