分類
1、按分離目的可分：實驗室毛細管電泳儀和工業毛細管電泳儀。
2、按分離對象的離子屬性可分：無機離子毛細管電泳儀和有機離子毛細管電泳儀。
3、按作用可分：毛細管定量分析電泳儀和毛細管定性分析電泳儀。
4、按分離原理可分：毛細管色譜電泳儀、毛細管區帶電泳儀和毛細管凝膠電泳儀等。
5、按分離特征可分：高效毛細管電泳儀、高選擇性毛細管電泳儀、高靈敏度毛細管電泳儀和高分離度毛細管電泳儀。
6、按用途可分：生物毛細管電泳儀、制藥毛細管電泳儀、化工毛細管電泳儀、食品毛細管電泳儀、蛋白質毛細管電泳儀、多肽毛細管電泳儀、氨基酸毛細管電泳儀和核酸毛細管電泳儀等。