一、霉菌不同
1、毛霉
毛霉又叫黑霉、長毛霉，是接合菌門，接合菌綱，毛霉目，毛霉科真菌中的一個大屬。毛霉以孢囊孢子和接合孢子繁殖，在土壤、糞便、禾草及空氣等環境中存在。
2、根霉
根霉的菌絲無隔膜、有分枝和假根，營養菌絲體上產生匍匐枝，匍匐枝的節間形成特有的假根，從假根處向上叢生直立、不分枝的孢囊梗，頂端膨大形成圓形的孢子囊，囊內產生孢囊孢子。
3、曲霉
曲霉，是發酵工業和食品加工業的重要菌種，已被利用的近60種。廣泛分布在谷物、空氣、土壤和各種有機物品上。主要作用是釀酒，制醋等。
4、青霉
一般指青霉屬。為分布很廣的子囊菌綱中的一屬，和曲霉屬有親緣關系，有二百幾十種，代表種是灰綠青霉，從土壤或空氣中很易分離。
分枝成帚狀的分生孢子從菌絲體伸向空中，各頂端的小梗產生鏈狀的青綠—褐色的分生孢子。已知在生理學方面類似曲霉屬，同時有很多能產生毒枝菌素。
二、特征不同
1、毛霉
毛霉以孢囊孢子和接合孢子繁殖。菌絲無隔、多核、分枝狀，在基物內外能廣泛蔓延，無假根或匍匐菌絲。不產生定形淡黃色菌落。菌絲體上直接生出單生、總狀分枝或假軸狀分枝的孢囊梗。
2、根霉
米根霉在分類上屬于接合菌亞門(Zygomycota)，接合菌綱(Zygomycetes)，毛霉目(Mucorales)，毛霉科(Mucoraceae)，根霉屬(Rhizopus)。菌落疏松或稠密，最初呈白色，后變為灰褐色或黑褐色。
3、曲霉
粬霉廣泛分布在谷物、空氣、土壤和各種有機物品上。生長在花生和大米上的粬霉，有的能產生對人體有害的真菌毒素，如黃粬霉毒素B1能導致癌癥，有的則引起水果、蔬菜、糧食霉腐。
4、青霉
青霉的營養體為無色或淡色的菌絲體，菌絲各細胞之間有橫隔膜，細胞內通常為多核，整個菌絲體分為伸入營養基質中吸取營養的基質菌絲和伸向空氣中的氣生菌絲，在氣生菌絲上產生簡單的長而直立的分生孢子梗。
三、用途不同
1、毛霉
毛霉的用途很廣，常出現在酒藥中，能糖化淀粉并能生成少量乙醇，產生蛋白酶，有分解大豆蛋白的能力，我國多用來做豆腐乳、豆豉。
許多毛霉能產生草酸、乳酸、琥珀酸及甘油等，有的毛霉能產生脂肪酶、果膠酶、凝乳酶等。常用的毛霉主要有魯氏毛霉和總狀毛霉。腐生，廣泛分布于酒曲、植物殘體、腐敗有機物、動物糞便和土壤中。
2、根霉
根霉在自然界分布很廣，用途廣泛，其淀粉酶活性很強，是釀造工業中常用糖化菌。我國最早利用根霉糖化淀粉（即阿明諾法）生產酒精。
根霉能生產延胡索酸、乳酸等有機酸，還能產生芳香性的酯類物質。根霉亦是轉化甾族化合物的重要菌類。與生物技術關系密切的根霉主要有黑根霉、華根霉和米根霉。
3、曲霉
因為曲霉具有分解蛋白質等復雜有機物的絕招，從古至今，它們在釀造業和食品加工方面大顯身手。早在二千多年前，我國人民已懂得依靠曲霉來制醬；民間釀酒造醋，常把它請來當主角。
我國特有的調制品豆豉，也是曲霉分解黃豆的杰作。現代工業則利用曲霉生產各種酶制劑、有機酸，以及農業上的糖化飼料。
4、青霉
青霉屬于曲霉科（Eurotiaceae)，青霉和曲霉都為常見屬，二者的主要鑒別特征是孢子梗的排列不同，曲霉的孢子梗是輻射狀排列，呈頭狀，青霉與人類生活息息相關。少數種類能引起人和動物的疾病。
