治療直接針對全垂體功能低下癥的靶腺激素替代治療，成人GH缺乏不必處理。
當垂體功能減退由于垂體腫瘤，特殊處理必須針對腫瘤及激素替代治療，這些腫瘤的恰當處理有爭論，如腫瘤小，不分泌PRL，大多支持經蝶腫瘤切除。大多數內分泌學者任其腫瘤大小，主張溴隱停作催乳素瘤的起始治療。
有證據指出：>2cm大的腺瘤伴有極高催乳素血癥病人，除了溴隱停治療外，需要外科和放射治療。同樣可用超高壓治療，大的腫瘤向鞍上擴散，經額或進蝶完全切除腫瘤已不可能，可采用超高壓放療。外科治療和放射后可以喪失其他垂體激素功能。放射病人可在數年中逐漸喪失內分泌功能，也可由于視交叉纖維化出現視力障礙。
此外，治療后激素水平應需反復評估，開始最好在3和6個月，然后每年測定。
垂體卒中,如有視野障礙或動眼神經突然麻痹，或如因下丘腦壓迫，嗜睡漸至暈迷，應立即外科治療。雖然大劑量皮質激素內科治療和一般支持對少數病例已足夠，但作為出血性腫瘤常規進蝶減壓應立即進行。